MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p06

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018489	GTT	2	6	28	33	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018489	A	6	6	47	52	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018489	ATT	2	6	58	63	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018489	CTTTT	2	10	173	182	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018489	ACA	2	6	261	266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018489	A	7	7	269	275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018489	TA	3	6	311	316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018489	GA	3	6	332	337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018489	T	6	6	590	595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018489	AGG	2	6	622	627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018489	ACT	2	6	830	835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018489	GA	3	6	962	967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018489	CAA	2	6	1040	1045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018489	T	7	7	1066	1072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018489	TAG	2	6	1076	1081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018489	TAT	2	6	1220	1225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018489	AAT	2	6	1285	1290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018489	GAAATG	2	12	2388	2399	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018489	TA	3	6	2440	2445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018489	TCC	2	6	2477	2482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_018489	GAGT	2	8	2492	2499	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018489	A	6	6	2604	2609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018489	TTA	2	6	2741	2746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018489	ATA	2	6	2812	2817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018489	GTTCC	2	10	2901	2910	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_018489	TAA	2	6	3061	3066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018489	GAT	2	6	3068	3073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018489	GCG	2	6	3156	3161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018489	TA	3	6	3220	3225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018489	ATC	2	6	3230	3235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018489	TA	3	6	3298	3303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018489	TAG	2	6	3313	3318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018489	GTC	2	6	3340	3345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018489	A	7	7	3527	3533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018489	ATTA	2	8	3556	3563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018489	TAG	2	6	3567	3572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018489	ATT	2	6	3587	3592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018489	TAA	2	6	3649	3654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018489	TGT	2	6	3700	3705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018489	ATAA	2	8	4127	4134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018489	GGA	2	6	4167	4172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018489	A	6	6	8036	8041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018489	T	7	7	8054	8060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018489	CTA	2	6	8081	8086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018489	AAAGAA	2	12	8120	8131	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018489	CAAAT	2	10	8147	8156	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018489	ACT	2	6	8213	8218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018489	AACAA	2	10	8229	8238	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018489	T	6	6	8263	8268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018489	ACA	2	6	8357	8362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018489	T	6	6	8466	8471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018489	GTT	2	6	8472	8477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018489	AT	3	6	8478	8483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018489	TGT	2	6	8505	8510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018489	ATTA	2	8	8524	8531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018489	GTT	2	6	9238	9243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018489	TTA	2	6	9244	9249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018489	TTAA	2	8	9262	9269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018489	CAAAT	2	10	9327	9336	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018489	TGA	2	6	9353	9358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018489	GTT	3	9	9383	9391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018489	TCC	2	6	9432	9437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_018489	TAT	2	6	9563	9568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018489	A	6	6	9631	9636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018489	GCG	2	6	9670	9675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018489	CGG	2	6	9727	9732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018489	TAT	3	9	9778	9786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018489	ATA	2	6	9831	9836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018489	AT	3	6	10402	10407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018489	ATAC	2	8	10441	10448	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018489	CCA	2	6	10449	10454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_018489	ACTTC	2	10	10462	10471	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_018489	TTAC	2	8	10496	10503	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018489	CTT	2	6	10521	10526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018489	GCG	2	6	10567	10572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018489	CCT	2	6	11306	11311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_018489	CAT	2	6	11321	11326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018489	ATT	2	6	11333	11338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018489	TAC	2	6	11493	11498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018489	TAAAG	2	10	11515	11524	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018489	GTTAT	2	10	11547	11556	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018489	GTT	2	6	11568	11573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018489	ACA	2	6	11586	11591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018489	AAG	2	6	11600	11605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018489	ACTCTT	2	12	12312	12323	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018489	TTA	2	6	12324	12329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018489	AGG	2	6	12336	12341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018489	AGA	2	6	13810	13815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018489	CA	3	6	13822	13827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018489	C	7	7	13838	13844	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91	NC_018489	TA	3	6	13850	13855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018489	TA	3	6	13858	13863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018489	ATA	2	6	13897	13902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018489	TAA	2	6	13960	13965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018489	TAT	2	6	13967	13972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018489	A	6	6	14026	14031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.